Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TspoP50637 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TspoP50637 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms