Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
GdnfP48540 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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