Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkn1bP46414 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms