Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtgfrP43117 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms