Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Mmp9P41245 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Mmp9P41245 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mmp9P41245 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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