Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
VhlP40338 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
VhlP40338 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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VhlP40338 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
VhlP40338 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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VhlP40338 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
VhlP40338 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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