Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KdrP35918 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KdrP35918 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KdrP35918 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms