Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprkP35822 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprkP35822 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprkP35822 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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