Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hes1P35428 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms