Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Apoc1P34928 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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