Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nedd1P33215 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms