Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cd28P31041 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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