Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
VtnP29788 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VtnP29788 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
VtnP29788 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
VtnP29788 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VtnP29788 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms