Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtprmP28828 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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