Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PdgfraP26618 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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