Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChgaP26339 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms