Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ggta1P23336 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ggta1P23336 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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