Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RarbP22605 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RarbP22605 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RarbP22605 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RarbP22605 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RarbP22605 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RarbP22605 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RarbP22605 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RarbP22605 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RarbP22605 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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