Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P18528 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
P18528 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
P18528 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms