Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P18526 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
P18526 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18526 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18526 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms