Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P18524 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P18524 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18524 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18524 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms