Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtpraP18052 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PtpraP18052 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms