Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gata1P17679 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms