Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gabra6P16305 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms