Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxa6P09092 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Hoxa6P09092 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxa6P09092 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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