Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P06335 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P06335 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P06335 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06335 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06335 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06335 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06335 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06335 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P06335 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P06335 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P06335 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms