Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgfb1P04202 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgfb1P04202 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgfb1P04202 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgfb1P04202 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Tgfb1P04202 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tgfb1P04202 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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