Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cops6O88545 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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