Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Stra6O70491 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Stra6O70491 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stra6O70491 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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