Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Lnx1O70263 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms