Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gfi1bO70237 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gfi1bO70237 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gfi1bO70237 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gfi1bO70237 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gfi1bO70237 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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