Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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