Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
E2f6O54917 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
E2f6O54917 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms