Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Psmb10O35955 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms