Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Timm44O35857 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Timm44O35857 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Timm44O35857 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Timm44O35857 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms