Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Cited2O35740 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms