Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Opn1mwO35599 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms