Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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