Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmiO35309 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmiO35309 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmiO35309 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NmiO35309 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NmiO35309 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NmiO35309 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NmiO35309 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NmiO35309 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NmiO35309 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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NmiO35309 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmiO35309 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmiO35309 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NmiO35309 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NmiO35309 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NmiO35309 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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NmiO35309 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms