Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr1aO35134 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms