Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Cldn34c3J3QJW5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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