Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm21719J3KMI9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm21719J3KMI9 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm21719J3KMI9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm21719J3KMI9 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
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Gm21719J3KMI9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm21719J3KMI9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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