Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Taf4bG5E8Z2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Taf4bG5E8Z2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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