Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Vmn1r58G3X9U3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms