Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ScaperF8VQ70 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms