Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm6285-201ENSMUST00000122012 498 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm15347-201ENSMUST00000145372 385 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ryr1E9PZQ0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm14344-201ENSMUST00000139338 580 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b3-204ENSMUST00000222783 1184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ryr1E9PZQ0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms