Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rdh8D3Z6W3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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