Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Vpreb3D3Z6J4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms