Protein–RNA interactions for Protein: D3YV94

Lce6a, Late cornified envelope 6A, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce6aD3YV94 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm8224-201ENSMUST00000166178 497 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lce6aD3YV94 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms