Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cttnbp2B9EJA2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cttnbp2B9EJA2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms